Ботанический сад, основанный в 1714 году на Вороньем (Аптекарском) острове, первоначально назывался «Аптекарским», а затем «Санкт-Петербургским медицинским огородом». Он был создан для выращивания лекарственных растений и на протяжении всего XVIII столетия служил этой утилитарной цели. Научные исследования велись в другом Ботаническом саду, основанном Академией наук в 1735 году. Этот сад находился на Васильевском острове, между 1-й и 2-й линиями, занимая часть так называемого «Бонова двора» и смежного с ним участка Московского подворья.